案件立案后，即便双方已达成和解，后续处理仍需谨慎操作。依据《刑事诉讼法》，若符合一定条件，犯罪嫌疑人真诚悔罪并获得被害人谅解，双方可进行和解。不及时妥善处理可能会影响案件的进展和当事人的权益保障。
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在案件立案后，根据具体案情和当事人意愿，可选择和解或公诉方式处理。和解可迅速解决纠纷，减轻司法负担；公诉则由国家机关追诉，确保公正处理。
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关于立案后的和解操作，具体步骤包括：1. 双方协商并确定赔偿等事宜；2. 签署正式的和解协议；3. 向司法机关提交和解协议，并申请撤案或不起诉。确保和解是自愿且合法的，以保证其法律效力。