协助调查时手机若涉案会被扣押，非涉案则不会。《治安管理处罚法》规定，仅涉案物品可被扣押，与案件无关的物品不得扣押。若手机被错误扣押未及时处理，可能影响个人通讯与正常生活。
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协助调查手机处理分情况。1. 若手机涉案，警方会依法扣押作为证据。2. 若手机非涉案物品，应交派出所保管，警方会开具暂扣单，调查结束后凭单领回手机。3. 在任何情况下，都应配合警方调查，同时确保个人合法权益不受侵犯。
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手机处理视涉案情况而定，涉案则扣押，非涉案则保管。选择处理方式需依据手机是否与案件有关，涉案必须扣押，非涉案则交由派出所保管并开具暂扣单，结束后领回。